MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187074	CAA	2	6	812	817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248757
2	NT_187074	GGC	2	6	826	831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248757
3	NT_187074	T	6	6	878	883	0 %	100 %	0 %	0 %	409248757
4	NT_187074	ATT	2	6	890	895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248757
5	NT_187074	TGG	2	6	929	934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248757
6	NT_187074	CGCGG	2	10	998	1007	0 %	0 %	60 %	40 %	409248757
7	NT_187074	ATC	2	6	1079	1084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248757
8	NT_187074	GCGG	2	8	1111	1118	0 %	0 %	75 %	25 %	409248757
9	NT_187074	GCA	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248757
10	NT_187074	TGA	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248757
11	NT_187074	CTTG	2	8	1150	1157	0 %	50 %	25 %	25 %	409248757
12	NT_187074	CGC	2	6	1210	1215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248757
13	NT_187074	GCC	2	6	1280	1285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248757
14	NT_187074	TAT	2	6	1306	1311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248757
15	NT_187074	TCC	2	6	1325	1330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248757
16	NT_187074	GTCA	2	8	1360	1367	25 %	25 %	25 %	25 %	409248757
17	NT_187074	TGG	2	6	1377	1382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248757
18	NT_187074	GAA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248757
19	NT_187074	GAC	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248757
20	NT_187074	CGC	2	6	1525	1530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248758
21	NT_187074	ATT	2	6	1585	1590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248758
22	NT_187074	TGA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248758
23	NT_187074	GCG	2	6	1712	1717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248758
24	NT_187074	TGGCG	2	10	1722	1731	0 %	20 %	60 %	20 %	409248758
25	NT_187074	CCG	2	6	1745	1750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248758
26	NT_187074	GC	3	6	1751	1756	0 %	0 %	50 %	50 %	409248758
27	NT_187074	TAC	2	6	1778	1783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248758
28	NT_187074	GCCA	2	8	1785	1792	25 %	0 %	25 %	50 %	409248758
29	NT_187074	GCT	2	6	1899	1904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248758
30	NT_187074	TAA	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248758
31	NT_187074	CCG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248759
32	NT_187074	AGA	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248759
33	NT_187074	ATT	2	6	2050	2055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248759
34	NT_187074	CGG	4	12	2163	2174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248759
35	NT_187074	CGA	2	6	2186	2191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248759
36	NT_187074	GCC	2	6	2216	2221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248759
37	NT_187074	AAC	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248759
38	NT_187074	GTC	2	6	2245	2250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248759
39	NT_187074	GAG	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248759
40	NT_187074	GATC	2	8	2409	2416	25 %	25 %	25 %	25 %	409248759
41	NT_187074	ACC	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248759
42	NT_187074	CCG	2	6	2456	2461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248759
43	NT_187074	GCC	2	6	2491	2496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248759
44	NT_187074	GGC	2	6	2509	2514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248759
45	NT_187074	CTG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248759
46	NT_187074	GCA	3	9	2555	2563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248759
47	NT_187074	A	6	6	2563	2568	100 %	0 %	0 %	0 %	409248759
48	NT_187074	ACT	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248759
49	NT_187074	GGC	2	6	2689	2694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248759
50	NT_187074	ACC	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248759
51	NT_187074	CGG	2	6	2735	2740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248759
52	NT_187074	ACGGCA	2	12	2801	2812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248759
53	NT_187074	GAC	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248759
54	NT_187074	GCC	2	6	2956	2961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248759
55	NT_187074	GC	3	6	3055	3060	0 %	0 %	50 %	50 %	409248759
56	NT_187074	TC	3	6	3321	3326	0 %	50 %	0 %	50 %	409248760
57	NT_187074	GCC	2	6	3329	3334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248760
58	NT_187074	CGG	2	6	3368	3373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248760
59	NT_187074	CGC	2	6	3426	3431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248760
60	NT_187074	CAG	2	6	3485	3490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248760
61	NT_187074	GCG	2	6	3516	3521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248760
62	NT_187074	GCC	3	9	3554	3562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248760
63	NT_187074	CAA	2	6	3716	3721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248760
64	NT_187074	AGC	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248760
65	NT_187074	GACG	2	8	4010	4017	25 %	0 %	50 %	25 %	409248760
66	NT_187074	CGA	2	6	4036	4041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248760
67	NT_187074	GCTTAT	2	12	4061	4072	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409248760
68	NT_187074	GTT	2	6	4167	4172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248761
69	NT_187074	CGC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248761
70	NT_187074	GC	3	6	4226	4231	0 %	0 %	50 %	50 %	409248761
71	NT_187074	AATC	2	8	4248	4255	50 %	25 %	0 %	25 %	409248761
72	NT_187074	CG	3	6	4270	4275	0 %	0 %	50 %	50 %	409248761
73	NT_187074	ATA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248761
74	NT_187074	GCA	3	9	4362	4370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248761
75	NT_187074	TCT	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248761
76	NT_187074	CTTT	2	8	4479	4486	0 %	75 %	0 %	25 %	409248761
77	NT_187074	CAG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248761
78	NT_187074	ATC	2	6	4612	4617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248761
79	NT_187074	AAT	2	6	4623	4628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248761
80	NT_187074	CCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248761
81	NT_187074	TGT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248761
82	NT_187074	CAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248761
83	NT_187074	CCG	2	6	4836	4841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248761
84	NT_187074	C	7	7	4858	4864	0 %	0 %	0 %	100 %	409248761
85	NT_187074	GT	3	6	4877	4882	0 %	50 %	50 %	0 %	409248761
86	NT_187074	TCA	2	6	5047	5052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248762
87	NT_187074	GCC	2	6	5155	5160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248763
88	NT_187074	ATA	2	6	5298	5303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248763
89	NT_187074	GCA	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248763
90	NT_187074	ACG	2	6	5327	5332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248763
91	NT_187074	CTT	2	6	5350	5355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248763
92	NT_187074	AT	3	6	5436	5441	50 %	50 %	0 %	0 %	409248763
93	NT_187074	TCG	2	6	5470	5475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248763
94	NT_187074	GGTTGT	2	12	5476	5487	0 %	50 %	50 %	0 %	409248763
95	NT_187074	AAC	2	6	5963	5968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248764
96	NT_187074	AT	3	6	5998	6003	50 %	50 %	0 %	0 %	409248764
97	NT_187074	TAA	2	6	6037	6042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248764
98	NT_187074	CAG	2	6	6470	6475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248765
99	NT_187074	A	6	6	6540	6545	100 %	0 %	0 %	0 %	409248765
100	NT_187074	ATA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248765
101	NT_187074	GAC	2	6	6607	6612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248765
102	NT_187074	CTGC	2	8	6616	6623	0 %	25 %	25 %	50 %	409248765
103	NT_187074	A	6	6	6709	6714	100 %	0 %	0 %	0 %	409248765
104	NT_187074	GGC	2	6	6781	6786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248765
105	NT_187074	CGA	2	6	6826	6831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248765
106	NT_187074	GTC	2	6	6936	6941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248765
107	NT_187074	CTT	2	6	6995	7000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248765
108	NT_187074	CGT	2	6	7096	7101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248765
109	NT_187074	CAA	2	6	7166	7171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248765
110	NT_187074	CCTG	2	8	7212	7219	0 %	25 %	25 %	50 %	409248765
111	NT_187074	ACG	2	6	7246	7251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248765
112	NT_187074	A	6	6	7295	7300	100 %	0 %	0 %	0 %	409248765
113	NT_187074	AGCG	2	8	7304	7311	25 %	0 %	50 %	25 %	409248765
114	NT_187074	ATC	2	6	7445	7450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248766
115	NT_187074	CAG	2	6	7466	7471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248766
116	NT_187074	GCT	2	6	7474	7479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248766
117	NT_187074	TGC	2	6	7494	7499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248766
118	NT_187074	TCTT	2	8	7527	7534	0 %	75 %	0 %	25 %	409248766
119	NT_187074	CGC	2	6	7541	7546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248766
120	NT_187074	ATT	2	6	7628	7633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248766
121	NT_187074	CGC	2	6	7720	7725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248766
122	NT_187074	GCC	2	6	7733	7738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248766
123	NT_187074	GC	3	6	7741	7746	0 %	0 %	50 %	50 %	409248766
124	NT_187074	ATG	2	6	7794	7799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248766
125	NT_187074	TTA	2	6	7923	7928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248766
126	NT_187074	CGG	2	6	7962	7967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248766
127	NT_187074	CACG	2	8	8008	8015	25 %	0 %	25 %	50 %	409248766
128	NT_187074	TC	3	6	8047	8052	0 %	50 %	0 %	50 %	409248766
129	NT_187074	CGG	2	6	8057	8062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248766
130	NT_187074	GCC	2	6	8578	8583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248767
131	NT_187074	ATT	2	6	8598	8603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248767
132	NT_187074	CG	3	6	8662	8667	0 %	0 %	50 %	50 %	409248767
133	NT_187074	CAG	3	9	8724	8732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248767
134	NT_187074	CGT	2	6	8777	8782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248767
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262	NT_187074	GAAT	2	8	16194	16201	50 %	25 %	25 %	0 %	409248777
263	NT_187074	AACC	2	8	16231	16238	50 %	0 %	0 %	50 %	409248777
264	NT_187074	CTG	3	9	16292	16300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248777
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376	NT_187074	TAT	2	6	24057	24062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248782
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380	NT_187074	GTCG	2	8	24400	24407	0 %	25 %	50 %	25 %	409248782
381	NT_187074	TCA	2	6	24435	24440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248782
382	NT_187074	ATA	2	6	24631	24636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248782
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386	NT_187074	T	6	6	24977	24982	0 %	100 %	0 %	0 %	409248783
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390	NT_187074	T	6	6	25145	25150	0 %	100 %	0 %	0 %	409248783
391	NT_187074	GTT	2	6	25154	25159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248783
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499	NT_187074	GGA	3	9	32605	32613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248792
500	NT_187074	GTT	2	6	32614	32619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248792

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